Les archives du cerveau
Il y a des bugs qui plantent bruyamment, et il y a des bugs qui se taisent. Les pires sont les seconds : ils renvoient un résultat qui a l’air correct, et personne ne va vérifier un chiffre qui a l’air correct. C’est exactement ce qu’on vient de corriger dans BioPHP, en passant les séquences […]
ContinuerIl y a quelques semaines, je me suis attaquée à la migration d’un plug-in de BioPHP, BioTools, mon portage PHP 8 / Symfony des minitools BioPHP de Joseba Bikandi. Le projet était bloqué en Symfony 4.4, et sa dépendance sœur amelaye/biophp avait elle-même été migrée progressivement jusqu’à SF7 dans le cadre de sa propre montée […]
ContinuerTrois jours, cinq sessions accompagnée de Claude, un projet qui traînait du PHP 7.2 et du Symfony 4 comme un vieux pull qu’on n’ose plus jeter. Voici comment BioPHP, ma librairie de bioinformatique, s’est retrouvée propulsée jusqu’à PHP 8.5 et Symfony 7 — avec au passage quelques bugs qui n’attendaient qu’un changement de contexte pour […]
ContinuerIl y a quelques jours je suis tombée sur cet article, réponse à un tout autre billet de blog que j’avais plutôt trouvé pertinent. J’ai été à la fois dev et lead dev. J’ai pu me confronter à des problématiques de gestion d’équipe dans une structure où il y avait quelques soucis qui ne dépendaient […]
ContinuerRappelez-vous : dans mon article « Fuck you Masterboy », je mentionnais ce fameux site où j’avais crée mes premières lignes en PHP. C’était vers 2002-2003. Et comme je le mentionne dans « Comment archiver sans trop pleurer », je suis en train de gratter dans mes sources pour déterrer mes vieux projets. Et ça tombe bien, j’ai trouvé […]
ContinuerMine de rien, concernant mon métier j’ai fait mes premiers pas en commençant mes études, ce qui commence à faire … un petit paquet d’années. Du coup en fait j’ai gardé (presque) toutes mes archives … ce qui n’est pas problématique quand on est en « full HTML » mais quand on passe en PHP, là c’est […]
ContinuerLe souci de la librairie d’origine de BioPHP, c’est son absence de design pattern. Le code d’origine prévoyait d’inclure deux systèmes de bases de données (Genbank et Swissprot en l’occurence) voire d’autres, car j’ai vu une dizaine d’autres formats. Or le but du jeu c’est d’avoir une structure assez carrée pour pouvoir ensuite manipuler les […]
ContinuerJ’aime bien la biologie, depuis ma tendre enfance. Je pensais même pouvoir un jour pouvoir faire de la bioinformatique mais j’ai vite été lassée des études en fac, donc j’ai dû faire un peu une croix sur ce projet. Then, I left to Marseille, tout ça … Mais dernièrement, j’ai eu pas mal de remous […]
ContinuerA la base, j’ignorais que ce genre de certifications existait jusqu’à peu, lorsque je suis allée fouiner sur le site de Zend, pour regarder ce que l’entreprise offrait en termes de formation Zend Framework 2 (parce que même si ça se casse la figure par rapport à Symfony, ça reste quand même un système assez […]
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